Bilgisayar Müh. Bölüm Binası, 1. kat, oda 107 Tel.:+90 (224) 294 2792 email: gozcan at uludag.edu.tr
18
Dersin Web Adresi:
19
Dersin Amacı
Yüksek hacimli olan biyolojik verilerin/sinyallerin analiz edilme yöntemlerini ve algoritmalarını öğrenmek. Bu yöntemler ile medikal açıdan anlam taşıyan sonuçlar elde etmeyi öğrenmek.
20
Dersin Mesleki Gelişime Katkısı:
Biyolojik veri tabanlarının anlaşılması, bu veritabanlarını işlemek için gerekli algoritma tasarımları yapabilmesi
21
Ders Öğrenme Kazanımları
1
Yüksek hacimli biyolojik verilerin analiz edilmesi için kullanılan algoritmaları öğrenir.;
2
Problemlerin çözümünde olasılıksal tahmin yapan yöntemleri öğrenir;
3
Geliştirilen algoritmaların medikal açıdan önemimi anlar.;
22
Dersin İçeriği
Hafta
Teori
Uygulama
1
Biyoinformatik ve hesaplama konusunda karşılaşılan sorunlar
2
İkili hizalama algoritmaları
3
Kısa sekans hizalama
4
Veri Tabanı ile hizalama, BLAST
5
Çoklu sekans hizalama
6
Motif bulma algoritmaları
7
Olasılıksal Yöntem Algoritmaları
8
Filojeni Algoritmaları
9
Yeni kuşak hizalama (NGS)
10
Genomik toparlama, lnc RNA
11
Biyolojik ağlar
12
RNA tahmini
13
Protein yapı tahmini
14
Kanser ilaçlarının etkileşimi
23
Ders Kitabı, Referanslar ve/veya Diğer Kaynaklar:
1. Richard Durbin, Sean R. Eddy, Anders Krogh, Graeme Mitchison Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids , 1998
24
Değerlendirme
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI
SAYISI
KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav
1
25
Kısa Sınav
0
0
Ödev
2
15
Yıl sonu Sınavı
1
60
Toplam
4
100
Yıl içi çalışmalarının Başarıya Oranı
40
Finalin BAşarıya Oranı
60
Toplam
100
Derste Kullanılan Ölçme ve Değerlendirme Yaklaşımları
Ölçme ve değerlendirme, Bursa Uludağ Üniversitesi Önlisans ve Lisans Eğitim Öğretim Yönetmeliği ilkelerine göre yapılmaktadır.
Açıklama
Bağıl değerlendirme sistemi uygulanmaktadır. 1 Ara Sınav ve 1 Final sınavı yapılmaktadır.
25
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik
SAYISI
Süresi [Saat]
Toplam İş Yükü [Saat]
Teorik Dersler
14
3
42
Uygulamalı Dersler
0
0
0
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön çalışma, pekiştirme)
0
0
0
Ödevler
2
0
0
Projeler
0
0
0
Arazi Çalışmaları
0
0
0
Arasınavlar
1
50
50
Diğer
0
0
0
Yarıyıl Sonu Sınavları
1
58
58
Toplam İş Yükü
200
Toplam İş Yükü / 30 saat
5
Dersin AKTS Kredisi
5
26
PROGRAM YETERLİLİKLERİ İLE DERS ÖĞRENİN KAZANIMLARI İLİŞKİSİ TABLOSU
