Ders Öğretim Planı

BİYOKİMYA I

1	Dersin Adı:	BİYOKİMYA I
2	Dersin Kodu:	MBG3005-BH
3	Dersin Türü:	Zorunlu
4	Dersin Seviyesi:	Doktora
5	Dersin Verildiği Yıl:	0
6	Dersin Verildiği Yarıyıl:	0
7	Dersin AKTS Kredisi:	6
8	Teorik Ders Saati (saat/hafta):	3
9	Uygulama Ders Saati (saat/hafta):	0
10	Laboratuar Ders Saati (saat/hafta):	0
11	Dersin Önkoşulu	-
12	Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar	Yok
13	Dersin Dili:	Türkçe
14	Dersin Veriliş Şekli	Yüz yüze
15	Dersin Koordinatörü:	Dr. Ögr. Üyesi BURCU ERBAYKENT TEPEDELEN
16	Dersi Veren Diğer Öğretim Elemanları:
17	Ders Koordinatörünün İletişim Bilgileri:	Dr. Ögr. Üyesi Burcu ERBAYKENT TEPEDELEN e-posta: berbaykent@uludag.edu.tr 0 224 29 42847 Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Görükle Kampüsü, 16059 Bursa
18	Dersin Web Adresi:
19	Dersin Amacı	Biyokimya I dersi ile canlı materyalin yapı, organizasyon ve fonksiyonu hakkında moleküler düzeyde bilgi sağlamak temel hedeftir. Bu giriş dersinde; biyolojik bileşenlerin kimyası ve biyolojik fonksiyon ile ilişkilendirilmesi ve biyolojik makromoleküller hakkında temel bilgilerin verilmesi amaçlanmıştır.
20	Dersin Mesleki Gelişime Katkısı:	Organizmanın enerji ihtiyacını sağlayan, hücrelerin yapıtaşlarını oluşturan karbonhidrat, lipit ve proteinleri tanımlayabilme, Biyokimya temel konuları ile ilgili edindiği bilgileri yazılı ve sözlü olarak aktarabilme

Ders Öğrenme Kazanımları

1	Canlı sistemlerdeki Biyomoleküllerin temel bilgilerini kullanabilme becerisi;
2	Biyomoleküllerin yapı, fonksiyon ve organizmadaki rollerini anlayabilme;
3	Farklı biyomolekülleri tanıyabilme ve yaşam için vazgeçilmez özelliklerini anlayabilme becerisi;
4	Enzimler ve minerallerin özellikleri,sınıflandırılması ve fonksiyonlarını kavrayabilme, minerallerin eksiklik ve fazlalık durumunda meydana gelen bozuklukları değerlendirebilme;
5	Biyolojik proseslerdeki reaksiyon mekanizmalarını anlayabilme;
6	Biyokimya temel konuları ile ilgili edindiği bilgileri yazılı ve sözlü olarak aktarabilme;

22	Dersin İçeriği

Hafta	Teori	Uygulama
1	Biyokimyaya giriş, sulu ortamlardaki zayıf etkileşimler, non-kovalent etkileşimler
2	Amino asitler; yapı/stereokimya, sınıflandırma ve yanzincirlerin özellikleri, esansiyal amino asitler, amino asitlerin iyonizasyonları ve izoelektrik nokta, amino asit reaksiyonları ve amino asit kompozisyon analizi
3	Peptidler: sınıflandırma, peptid bağı ve yapısı; stabilite ve peptid bağı oluşumu, rotasyonlar, konformasyonlar, peptidlerin poliampolit özelliği, Peptid N-, C- Terminal analizi: Sanger ve Edman Degredasyonu
4	Proteinler; fonksiyonel ve yapısal sınıflandırma, Protein yapısının organizasyonu, Primer Yapı: protein dizilerinin tabiatı, Sekonder yapı: heliksler, tabaka yapılar, ß-Döngü, düzensiz sarmal yapılar, stabilite, karakteristik özellikler, Ramachandran eğrileri, süpersekonder yapı, protein motifleri ve domainleri
5	Tersiyer yapı:Tersiyer yapı oluşumunu etkileyen faktörler, Protein katlanmasının termodinamiği, Şaperonlar, Denaturasyon, Kuarternar yapı:multimerik yapılar, fibröz proteinlere örnekler; keratin, kollogen, elastin, Protein izolasyon ve saflaştırmasına genel bakış
6	Protein fonksiyonu: Oksijen transportu ve depolanması; Hemoglobin/Miyoglobin, kooperativite ve allosteri, allosterik değişim modelleri, Allosterik davranışa diğer ligantların etkileri, Bohr etkisi
7	Enzimler: Terminoloji, sınıflandırma ve genel özellikler
8	Enzimler:Katalizin prensipleri, enzim kataliz kinetiği ve kinetik parametreler, enzim inhibisyonu, enzim aktivitesinin düzenlenmesi
9	Koenzimler, vitaminler ve esansiyal metaller; Sınıflandırma, metabolit ve vitamin türevi koenzimlerin yapıları, enzim fonksiyonundaki rolleri, protein koenzimler, Esansiyal prekürsör olarak vitaminler, suda ve yağda çözünür vitaminler
10	Nükleik asitler: Nükleik asitlerin tabiatı, primer, sekonder ve tersiyer yapıları; baz eşleşmesi, ikili heliksler, dairesel DNA ve super sarmallar, Denaturasyon ve renaturasyon, DNA’nın erime noktası
11	Nükleik asitlerin biyolojik fonksiyonları, Moleküler biyolojiye bakış, genetik bilginin depolanması, genom, merkezi dogma
12	Protein Biyosentezi; Gen ekspresyonuna genel bakış, Replikasyon: semikonservatif replikasyon, replikasyon mekanizmaları,Telomerler ve telomerazlar, DNA hasarı ve tamiri, mutasyonlar, Transkripsiyon: genler ve operonlar, trankripsyonun regülasyonu ve inhibisyonu, intron ve ekzonlar, RNA prosesleme: caping, yarılmalar, poliadenilasyon
13	Karbohidratlar: Genel özellikleri, fonksiyonları, sınıflandırılması
14	Lipidler: Genel özellikleri, fonksiyonları, sınıflandırılması

23	Ders Kitabı, Referanslar ve/veya Diğer Kaynaklar:	1) Lehninger Principles of Biochemistry”, 5 th Edn. Palgrave Macmillan, (2008) 2) Voet D., Fundamentals of Biochemistry: Life at the molecular Level.(2008) 3) Horton R., Principles of Biochemistry, Prentis Hall (2005) 4) Boyer R. Interactive Concepts in Biochemistry 2/e, Wiley (2008)
24	Değerlendirme

YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI	SAYISI	KATKI YÜZDESİ
Ara Sınav	1	40
Kısa Sınav	0	0
Ödev	0	0
Yıl sonu Sınavı	1	60
Toplam	2	100
Yıl içi çalışmalarının Başarıya Oranı		40
Finalin BAşarıya Oranı		60
Toplam		100
Derste Kullanılan Ölçme ve Değerlendirme Yaklaşımları	Yazılı sınav
Açıklama	Bağıl değerlendirme sistemi uygulanmaktadır

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU

Etkinlik	SAYISI	Süresi [Saat]	Toplam İş Yükü [Saat]
Teorik Dersler	14	3	42
Uygulamalı Dersler	0	0	0
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön çalışma, pekiştirme)	14	4	56
Ödevler	0	20	40
Projeler	0	0	0
Arazi Çalışmaları	0	0	0
Arasınavlar	1	15	15
Diğer	0	0	0
Yarıyıl Sonu Sınavları	1	20	20
Toplam İş Yükü			188
Toplam İş Yükü / 30 saat			5,77
Dersin AKTS Kredisi			6

PROGRAM YETERLİLİKLERİ İLE DERS ÖĞRENİN KAZANIMLARI İLİŞKİSİ TABLOSU

	PY1	PY2	PY3	PY4	PY5	PY6	PY8	PY9	PY10
OK1	0	5	0	0	0	5	3	3	3
OK2	5	4	5	2	2	0	3	3	3
OK3	5	4	5	2	2	0	3	3	3
OK4	5	4	5	2	2	0	3	3	3
OK5	5	4	5	2	2	0	3	3	3
OK6	5	4	5	2	2	0	3	3	3

ÖK: Öğrenme Kazanımları

PY: Program yeterlilikleri

Katkı Düzeyi:

1 Çok Düşük

2 Düşük

3 Orta

4 Yüksek

5 Çok Yüksek